Как рассчитать пени при УСН Рассчитывайте пени так же, как и по другим налогам. Особенностей по УСН нет. Размер пеней зависит от суммы недоимки, числа дней просрочки и от ставки рефинансирования Банка России в период просрочки. Для пеней по авансовым платежам есть особенность: их нужно начислять максимум до срока уплаты налога за год.